小三通的影響

　　1、有利於降低人員和物資的流通成本，物流公司提高經濟和社會效益，進而促進經貿往來與經濟發展；

　　2、兩岸“三通”的實現，有利於加強兩岸合作，共同應對國際金融危機；

　　3、有利於小三通發揮台灣和大陸經濟互補的優勢，促進雙方的共同發展。

　　海峽兩岸三通平均使大陸與台灣的距離縮短1200公裡左右。縮小了中華文化圈的直徑。是有利於華人的好事情。有利於增強華人的生存能力。

　　兩岸本來希望透過小三通作試點，令兩岸全面三通能夠恢復過來。可是，基於自台灣李登輝時代後期的戒急用忍政策轉向，和繼任的陳水扁大陸貨運政府對中國大陸的態度，導致大陸海協會和台灣海基會的磋商陷於癱瘓，使得小三通未能引發全面三通。而小三通初期的相關配套措施，也因太匆促而不夠完善，導致使用者對小三通怨聲載道。而政府限制只有小三通貨運特定人士才能循小三通往返兩岸。

　　不過，小三通的確能夠加強福建和台灣之間的民間交流，可說是為日後的台商包機開設先例。從2001年開航以來，因為節省旅費旅程，逐漸成為台商往返兩岸的捷徑。2001年的旅客數只有2萬人次，成長到2005年的50萬人次。

　　小三通將在一定程度上帶動金廈及雙馬(馬祖與馬尾)地區區域經濟交流。由於兩地地理區位、文化背景一致，兩地通航將會促進該地區經貿、旅游、文化等多方兩岸貨運面的聯系。地方政府的積極性很高，有意兩岸物流推動兩地的合作與交流。